Projets primés (31)
Titre
Acronyme : IPER-BAR-BPCO
Titre : Impact de la PERsistance pulmonaire BActéRienne dans la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO)
Nom et prénom de l’investigateur-coordinateur
Promoteur
Domaine de Recherche
Structure responsable de la gestion de projet
Rationnel
La broncho-pneumopathie chronique obstructive (BPCO) est une pathologie respiratoire chronique inflammatoire marquée par des phases de stabilité ponctuées de phases d’exacerbations aiguës (EA), le plus souvent d’étiologie infectieuse. Haemophilus influenzae, Brahnamella catarrhalis, Streptococcus pneumoniae et Pseudomonas aeruginosa peuvent être responsables d’EA. Chez les patients BPCO, la prévalence des infections au cours des EA est de de 20-30% pour H. influenzae, 10-15% pour B. catarrhalis, 10-15% pour S. pneumoniae et 4-15% pour P. aeruginosa.
Deux modèles se distinguent concernant l’évolution des infections bactériennes:
- le premier décrit une EA suivie de l’élimination plus ou moins rapide de la bactérie,
- le deuxième décrit une EA suivie de la persistance au long cours de la même souche bactérienne.
L’impact de la persistance des bactéries pathogènes, Haemophilus influenzae, Brahnamella catarrhalis, Streptococcus pneumoniae et Pseudomonas aeruginosa, et la détermination de la colonisation chronique sur l’évolution clinique et la fréquence des EA de BPCO est peu décrit. Dans la BPCO, le diagnostic microbiologique classique d’infection bactérienne se base sur des cultures bactériologiques des expectorations (ECBC) avec un seuil de significativité de 107 UFC/ml.
Concernant les patients atteints de mucoviscidose, pour certaines bactéries, dont P. aeruginosa, l’infection à PA est diagnostiquée par des seuils de significativité plus bas sur les cultures bactériologiques des expectorations. De plus, la colonisation ou infection chronique se définit par plus de 50% des ECBC réalisés sur une année positif à P. aeruginosa. Dans la BPCO, l’intérêt de la détection des bactéries pathogènes décrites ci-dessus, en deçà des seuils biologiques classiques n’a jamais été démontrée.
Originalité et Caractère Innovant
L’originalité de cette étude pilote est d’étudier de façon prospective la présence au cours de l'EA sévère et la persistance à distance d’une EA de H. influenzae, B. catarrhalis, S. pneumoniae et P. aeruginosa au niveau pulmonaire chez des patients BPCO, en utilisant une approche culturomique complétée par une méthode PCR pour P. aeruginosa. Cela permettra d’évaluer la conséquence de la persistance bactérienne sur l’évolution clinique des patients.
Le caractère innovant de notre projet consiste à évaluer la possibilité de la présence de bactéries à un seuil inférieur aux seuils biologiques classiques dans les expectorations en utilisant (i) une approche de type culturomique pour la mise en culture des expectorations et (ii) une détection moléculaire spécifique de PA, plus sensible que la culture, qui permettront d’abaisser le seuil de détection par rapport aux méthodes habituellement utilisées. Les résultats de notre étude pourraient mener à terme à une modification des pratiques biologiques et cliniques.
Objet de la Recherche
- Etudier l’apport des techniques de détection améliorées sur la détection de H. influenzae, B. catarrhalis, S. pneumoniae, et P. aeruginosa dans les prélèvements réalisés lors de la prise en charge initiale et lors du suivi des patients atteints de BPCO avec EA sévère prise en charge en hospitalisation.
- Etudier la prévalence de la persistance de H. influenzae, B. catarrhalis, S. pneumoniae, et P. aeruginosa dans les prélèvements respiratoires de patients atteints de BPCO après une EA sévère à 6 semaines.
- Etudier l’impact clinique de la persistance de H. influenzae, B. catarrhalis, S. pneumoniae, et P. aeruginosa dans les prélèvements respiratoires réalisés à 6 semaines sur l’évolution clinique à 6 mois de patients atteints de BPCO après traitement bien conduit d'une EA prise en charge en hospitalisation, notamment sur la fréquence des exacerbations.
- Etudier la clonalité entre les souches bactériennes isolées dans les différents prélèvements respiratoires réalisés lors de la prise en charge initiale et lors du suivi des patients atteint de BPCO avec EA sévère prise en charge en hospitalisation.
Bénéfices attendus pour le patient et/ou pour la santé publique
Les résultats attendus sont l'évaluation de la fréquence de détection au cours de l'EA sévère et à distance de l'EA d'infection bactérienne sur analyse de l’expectoration, prenant en compte des seuils en en deçà des seuils biologiques classiques, qui pourrait induire une évolution clinique défavorable.
Ces résultats pourraient impliquer une modification des pratiques bactériologiques afin de détecter H. influenzae, B. catarrhalis, S. pneumoniae et P. aeruginosa même en deçà des seuils biologiques classiques (diminution des seuils de détection par approche culturomique et détection moléculaire sur prélèvement pour P. aeruginosa).
Une étude clinique randomisée de stratégie thérapeutique ayant pour but l’éradication de ces pathogènes pourrait être envisagée dans les suites de cette étude.
Mots Clés
Bibliographie
- Pseudomonas aeruginosa in chronic obstructive pulmonary disease. Murphy TF, Brauer AL, Eschberger K, Lobbins P, Grove L, Cai X, Sethi S. Am J Respir Crit Care Med. 2008 Apr 15
- Chronic obstructive pulmonary disease (COPD): evaluation from clinical, immunological and bacterial pathogenesis perspectives. Hassett DJ, Borchers MT, Panos RJ. J Microbiol. 2014 Mar;52(3):211-26.
- Pseudomonas aeruginosa population biology in chronic obstructive pulmonary disease. Rakhimova E, Wiehlmann L, Brauer AL, Sethi S, Murphy TF, Tümmler B. J Infect Dis. 2009 Dec 15;200(12):1928-35.
- Chronic Pseudomonas aeruginosa infection in chronic obstructive pulmonary disease. Martínez-Solano L1, Macia MD, Fajardo A, Oliver A, Martinez JL. Clin Infect Dis. 2008 Dec 15;47(12):1526-33.
-
Proposal of a quantitative PCR-based protocol for an optimal Pseudomonas aeruginosa detection in patients with cystic fibrosis Florence Le Gall, Rozenn Le Berre, Sylvain Rosec, Jeanne Hardy, Stéphanie Gouriou, Sylvie Boisramé-Gastrin, Sophie Vallet, Gilles Rault, Christopher Payan and Geneviève Héry-Arnaud. BMC Microbiology 2013 13:143.
Montant de la subvention
Titre
Acronyme : French hMPV study
Titre : Présentation, profil évolutif et pronostic des infections respiratoires basses communautaires à human Métapneumovirus chez l'adulte hospitalisé
Nom et prénom de l’investigateur-coordinateur
Promoteur
Hôpital Saint-Louis, 1 avenue Claude Vellefaux,
75475 Paris cedex 10
Domaine de Recherche
Structure responsable de la gestion de projet
Hôpital Saint-Antoine, 184 rue du Faubourg Saint-Antoine,
75012 Paris
Rationnel
Le métapneumovirus humain (hMPV) est un virus appartenant à la famille des paramyxovirus et est génétiquement proche du virus respiratoire syncitial (VRS). Son épidémiologie est saisonnière, de janvier à avril.
Au cours de la pneumonie de l’enfant, hMPV est le troisième pathogène le plus fréquemment identifié. hMPV est détecté chez 6 à 7 % des enfants présentant une fièvre ou un tableau respiratoire aigu et pourrait être à l'origine d'une hospitalisation par an pour 1000 enfants de moins de 5 ans.
Chez l'adulte hospitalisé les données sont plus rares. La présentation est polymorphe allant de la bronchite aigüe à la décompensation d’une maladie respiratoire chronique, jusqu'à la pneumonie. Le virus hMPV a été identifié chez 4 à 8% des sujets hospitalisés présentant une infection des voies aériennes basses, et chez 4% des sujets présentant une pneumonie. Les coinfections virales ne sont pas rares, tandis que la fréquence et l’épidémiologie des coinfections bactériennes sont méconnues. L’admission en réanimation concerne près d’un patient sur 10. Les sujets âgés et les patients immunodéprimés constituent probablement les populations à risque. Une seule cohorte de patients infectés à hMPV et admis en réanimation a été rapportée. Parmi les 40 patients inclus, 22 étaient ventilés, 19 présentaient un SDRA et 10 décédaient. Les facteurs de mauvais pronostic n’étaient pas étudiés.
Actuellement, le traitement des infections respiratoires basses à hMPV est essentiellement symptomatique. Cependant, plusieurs drogues anti-VRS en phase de développement clinique chez l'humain ont montré une activité sur les autres paramyxovirus (hMPV, virus parainfluenzae) in vitro et chez l'animal. Au terme de leur développement, ces drogues seront à disposition des cliniciens pour traiter les infections à VRS chez l’adulte. Compte tenu de leur activité intrinsèque sur les autres paramyxovirus, il est possible qu’elles soient utilisées au cours des infections respiratoires basses documentées à hMPV. Il est donc très important d’améliorer nos connaissances concernant ces infections à hMPV, en termes de présentation clinico-radio-biologique et de profil évolutif.
Originalité et Caractère Innovant
Objet de la Recherche
- Caractériser le pronostic des infections respiratoires basses communautaires à hMPV de l’adulte hospitalisé en secteur conventionnel, unité de soins intensifs ou réanimation
- Détailler la présentation clinique, radiologique et biologique à la prise en charge
- Décrire le profil évolutif, le délai de guérison, le taux de transfert en réanimation, et chez les patients admis en réanimation les défaillances d’organes, le recours à la ventilation mécanique et l’incidence du syndrome de détresse respiratoire aigüe
- Détailler les coinfections bactériennes et/ou virales
Bénéfices attendus pour le patient et/ou pour la santé publique
- Identifier les patients à risque de présenter une infection respiratoire basse grave à hMPV
- Identifier les patients les plus susceptibles de bénéficier dans le futur d'un traitement médicamenteux spécifique de l'infection à hMPV
- Cibler les patients éligibles aux futurs traitements médicamenteux spécifiques du hMPV
- Caractériser les infections respiratoires basses de l'adulte à hMPV afin de rationaliser l’application hospitalière des mesures de confinements
Mots Clés
Bibliographie
- Walsh EE, Peterson DR, Falsey AR. Human metapneumovirus infections in adults: another piece of the puzzle. Arch Intern Med 2008; 168:2489–2496.
- Edwards KM, Zhu Y, Griffin MR, Weinberg GA, Hall CB, Szilagyi PG, Staat MA, Iwane M, Prill MM, Williams JV, New Vaccine Surveillance Network. Burden of human metapneumovirus infection in young children. N Engl J Med 2013; 368:633–643.
- Hasvold J, Sjoding M, Pohl K, Cooke C, Hyzy RC. The role of human metapneumovirus in the critically ill adult patient. J Crit Care 2016; 31:233–237. • Jain S, Self WH, Wunderink RG, Fakhran S, Balk R, Bramley AM, Reed C, Grijalva CG, Anderson EJ, Courtney DM, Chappell JD, Qi C, Hart EM, Carroll F, Trabue C, Donnelly HK, Williams DJ, Zhu Y, Arnold SR, Ampofo K, Waterer GW, Levine M, Lindstrom S, Winchell JM, Katz JM, Erdman D, Schneider E, Hicks LA, McCullers JA, Pavia AT, et al. Community-Acquired Pneumonia Requiring Hospitalization among U.S. Adults. N Engl J Med 2015; 373:415–427.
- Visseaux B, Burdet C, Voiriot G, Lescure FX, Chougar T, Brugière O, Crestani, B, Casalino E, Charpentier C, Descamps D, Timsit JF, Yazdanpanah Y, Houhou-Fidouh N. Prevalence of respiratory viruses among adults, by season, age, respiratory tract region and type of medical unit in Paris, France, from 2011 to 2016. PLoS One 2017;12(7).
Montant de la subvention
Titre
Acronyme : FIT-H
Titre : Etude du risque de survenue d’une maladie thrombo-embolique veineuse chez les membres de la Famille au 1er degré de jeunes femmes ayant une maladie veineuse Thromboembolique en contexte Hormonal. Etude « FIT - H ».
Nom et prénom de l’investigateur-coordinateur
Promoteur
2 avenue Foch
29609 Brest Cedex
Domaine de Recherche
Structure responsable de la gestion de projet
Rationnel
La maladie veineuse thrombo-embolique (MVTE) est une maladie multifactorielle fréquente et grave qui survient en association avec des facteurs de risque acquis (essentiellement cliniques) ou génétiques (thrombophilies héréditaires) [1].
Parmi les facteurs acquis cliniques importants, l’exposition hormonale chez les jeunes femmes (contraception oestro-progestative, modifications hormonales liées à la grossesse) représente un problème majeur de santé publique étant donné la fréquence de cette exposition et du risque thrombotique associé [2].
En pratique, la recherche d’une thrombophilie héréditaire est souvent proposée chez des femmes en âge de procréer pour identifier celles qui sont à risque thrombotique avant la mise en route d’une contraception oestroprogestative ou avant une grossesse, qu’elles aient ou non un antécédent familial. Or la pertinence de cette pratique est discutable. Dans une importante étude portant sur 2830 apparentés au 1er degré de patients (propositi) ayant une MVTE [3], nous avons montré que le risque familial de MVTE était augmenté lorsque le propositi avait développé une MVTE avant 50 ans, que cette MVTE soit provoquée par un facteur majeur ou non et qu’une thrombophilie soit présente ou non chez les propositi. Ainsi, la présence ou l’absence d’une thrombophilie n’est pas discriminante pour identifier des sujets à risque thrombotique élevé, l’hypothèse sous-jacente étant que les patients qui développent une MVTE avant 50 ans sans thrombophilie détectable sont probablement porteurs d’une thrombophilie non identifiée à ce jour.
Le faible nombre de jeunes femmes incluses parmi les propositi dans notre étude n’a pas permis de déterminer si le risque familial de MVTE chez les jeunes femmes ayant une MVTE en présence d’une contraception oestro-progestative ou d’une grossesse était élevé ou non, indépendamment de la présence ou non d’une thrombophilie héréditaire détectable ; or déterminer l’importance de l’association entre le risque de MVTE chez les jeunes femmes en contexte hormonal et l’histoire thrombotique familiale, avec ou sans thrombophilie, est indispensable compte-tenu des enjeux cliniques, scientifiques et économiques (4,5).
Originalité et Caractère Innovant
- A notre connaissance, il s’agit de la première grande étude transversale réalisée spécifiquement chez les femmes en âge de procréer dont l’objectif est d’étudier le risque familial de MVTE associé avec la survenue d'une MVTE sous contraception oestro-progestative ou pendant la grossesse.
- Le diagnostic de MVTE sera établi selon une méthodologie rigoureuse et validée par notre équipe (Couturaud, Blood 2014, Chest 2009). Un kit sanguin centralisé sera prélevé systématiquement pour tous les propositi et apparentés au premier degré pour la recherche de thrombophilies héréditaires. Ainsi, cette étude a le potentiel de démontrer si la survenue d’une MVTE en contexte hormonal est associée à un risque familial accru et si ce risque est indépendant de la présence ou non d’une thrombophilie héréditaire. Les implications scientifiques, cliniques et médico-économiques en termes d’identification des jeunes femmes à risque thrombotique sont importantes.
- Cette étude sera réalisée dans le cadre d'un réseau expérimenté dans le domaine de la MVTE.
Objet de la Recherche
Objectif principal : démontrer, chez les apparentés (sujets de l’étude) au 1er degré de patientes en âge de procréer (propositi) ayant un premier épisode MVTE en contexte hormonal*, que le risque de MTVE est supérieur à celui des apparentés au 1er degré de propositi exposées au même contexte hormonal et n’ayant pas de MVTE.
Objectifs secondaires :
- Déterminer l’association entre le risque familial de MVTE et la présence, chez les propositi, d’une thrombophilie héréditaire fréquente (facteur V Leiden, mutation G20210A du gène de la prothrombine)
- Déterminer l’association entre le risque familial de MVTE et la présence, chez les propositi, d’une thrombophilie héréditaire rare (déficit en protéine C, S, antithrombine, double hétérozygote facteur V Leiden et mutation G20210A du gène de la prothrombine, facteur V Leiden homozygote, mutation ho
- Déterminer, chez les membres de famille au premier degré de propositi ayant une thrombophilie héréditaire détectable, le risque de MVTE associée à la présence de la même thrombophilie, et selon que le propositus a eu ou n’a pas eu de MVTE
- Déterminer l’impact des caractéristiques de membres de famille au premier degré sur le risque familial de MVTE: o âge des membres de famille (durée
- Déterminer l'impact d'autres variables du propositi sur le risque familial de MVTE : o âge de survenue de la MVTE, o sévérité et phénotype de la MVTE : EP versus TVP proximale versus TVP distale o Type d’exposition hormonale du propositi et risqu
- Déterminer l’impact du nombre de membres de famille symptomatiques sur le risque familial global
Bénéfices attendus pour le patient et/ou pour la santé publique
Bénéfice individuel:
- Le bénéfice individuel potentiel, pour les propositi avec ou sans MVTE ainsi que leurs membres de famille au 1er degré, est lié à l’amélioration de la connaissance de leur risque thrombotique et des déterminants de ce risque. Pour les membres de famille de propositi ayant eu une MVTE, l’étude a le potentiel de mieux identifier des sujets à risque thrombotique sur la base de marqueurs de risque plus pertinents (histoire familiale notamment).
- Pour les membres de famille de propositi n’ayant pas eu de MVTE, l’étude a le potentiel d’identifier des sujets à risque qui ne l’auraient pas été hors protocole ; mais cette étude a aussi le potentiel d’identifier des membres de famille à faible risque.
- Pour tous les membres de famille, au cours de la consultation prévue à l’inclusion, une information sera délivrée sur la fréquence, les facteurs de risque, les signes cliniques (éducation aux symptômes de TVP et d’EP) et le pronostic de la MVTE ; les modalités de prévention primaires et secondaires seront abordées. Au besoin, une aide au sevrage tabagique sera proposée en cas d’intoxication tabagique ; une aide diététique en cas de surpoids (ces éléments ne sont pas compris dans l’étude, mais la participation des patients à l’étude peut déboucher sur des prises en charge spécifiques de soins courants).
Bénéfice collectif : Les implications de l’étude sont importantes pour trois raisons :
- clinique : cette étude a le potentiel de démontrer que l’histoire familiale et la nature de la MVTE sont plus informatives et discriminantes que les données biologiques (thrombophilie héréditaire) pour identifier les jeunes femmes à risque accru de MVTE en contexte hormonal. Cette étude contribue donc à identifier plus adéquatement un groupe de jeunes femmes à risque thrombotique chez qui un renforcement de la prévention primaire (ex : contre-indication aux oestro-progestatifs, compression veineuse pendant la grossesse, voire thromboprophylaxie pendant le post-partum, etc.) peut être proposé et à remettre en cause l’intérêt d’un bilan thrombolique systématique chez les jeunes femmes en âge de procréer.
- scientifique: cette étude permet d’identifier des jeunes femmes à haut risque thrombotique sans thrombophilie héréditaire détectable chez qui il est probable qu’une thrombophilie héréditaire non identifiée soit présente; la banque biologique permettra ultérieurement des analyses génétiques.
- médico-économique: le risque de MVTE en contexte hormonal est faible mais cette exposition concerne toutes les jeunes femmes en âge de procréer et constitue un enjeu majeur de santé publique. Par l’identification des femmes à risque thrombotique sur des critères plus discriminants, cette étude a le potentiel de contribuer à diminuer la fréquence et donc le coût des complications thrombo-emboliques; la démonstration de l’inutilité d’une recherche systématique de thrombophilie héréditaire contribue aussi à une réduction majeure des coûts de santé liés à ces examens.